1990年代至2000年以前，大韩航空的飞行安全倍受权威部门注视。伦敦斯坦斯泰德机场（Stansted Airport）严重坠机事故发生后，大韩航空被指责为“航空界安全记录最差的航空公司之一”。在强大的批评压力之下，大韩航空的始创人之一赵亮镐(Cho Yangho)也只得忍气吞声，承担责任。
频繁的飞行事故，导致90年代末期加拿大航空（Air Canada）、法国航空（Air France）、达美航空（Delta Airlines）中止与大韩航空实行“代码共享计划”。美国国防部（US Department of Defense）也多次将大韩航空公司列入黑名单，并力劝部门工作人员尽可能避免乘坐大韩航空的班机。舆论批评的矛头多指向大韩航空高层管理人员的非专业化，人事提拔多靠人际关系而非严格的考核制度。
导致大韩航空飞行安全问题的另一个因素是有着韩国封建文化的驾驶舱等级制度。由于飞行员大多是由退役空军机师担任，因此，军队内阶级观念制度也被带到航空公司内。年轻的飞行员不允许对资深的飞行员的决定提出任何异议，即使是犯错也不可提出指正。1991年6月13日的机腹迫降事件便是由这一制度所引致。事后调查显示，副机长曾经拒绝切断机舱内的警报器，然而机长却强制命令他执行。澳洲民用航空调查委员会主席米克托勒把这种等级制度描绘成“具有亚洲（基本上是韩国）特色的权威等级”，在飞机上，机长永远是上帝，没有任何人敢和他进行辩论。
[编辑]事件与事故
1958年2月16日，一架道格拉斯DC3型飞机从釜山飞往首尔的途中被8名劫机分子劫持飞往朝鲜首都平壤。
1969年12月11日，一架YS-11-125从江陵市飞往首尔途中再次被劫机分子劫持至平壤，人机下落至今仍不明。
1971年1月23日，一架福克F-27从江陵飞往首尔途中，一名劫机分子用手榴弹将飞机劫持至束草市，迫降在海洋上，副机长和劫机犯被炸死。
1976年8月2日，一架波音707货机从伊朗首都德黑兰飞往首尔。飞机从29号跑道起飞升空后，没有按照标准仪表离场规则进行左转，而是右转飞向一座山头。飞机在海拔2020米（6630英呎）高度撞山坠毁，5名机组人员全部罹难。
1978年4月20日，大韩航空902号班机（波音707），由法国巴黎飞往美国阿拉斯加州安克雷奇市。在距离北极点780公里处，加拿大航空管制员告知该航班的飞师，飞机已偏离预定航线。机师未能正确执行操作，反而将飞机偏航至白令海上空，而此处刚好是苏联领空。苏联防空雷达起初认为是一架波音747，并派出苏15战斗机进行拦截。当战斗机接近波音707后，韩国飞行员请求着陆并开启了着陆灯。然而，苏15战斗机已接到将客机击落的命令。根据美国情报局资料显示，苏联飞行员曾多次试图让上级相信这只是一架民航客机并且请求取消攻击指令。最终，苏联飞行员不得不服从命令，发射两枚P-60导弹。第一枚导弹错过了目标，但第二枚导弹却击中了客机的左边机翼，使左翼严重受损。导弹碎片更击穿了机身，导致2名乘客因为机舱气压急剧降低而死亡。韩国机师将客机紧急下降至1500米高空。密密的云层使得苏联战斗机失去了目标，保护了客机。机师控制客机继续在低空飞行至科拉半岛上空，并且努力寻找可降落地点。随著夜幕的降临，在经过多次努力后，客机终于安全降落在科皮亚维湖（Lake Korpijärvi）的冰面上。除2名遇难乘客外，其他乘客及机员均被苏联直升机所营救。
1980年11月19日，执行015号航班的波音747-2B5B客机（机身编号HL7445）由美国安克雷奇市飞往韩国首尔。在降落过程中，由于能见度低，飞机撞上机场旁边的拦水坝后，在14号跑道坠毁，机身解体并引发大火。6名机组人员（共15名机组成员）、8名乘客（共198名乘客）及地面上1人死亡。
1983年9月1日，大韩航空007号班机 误闯苏联领空，遭苏联空军战斗机击落于库页岛西南方的公海。269人遇难。
1985年5月18日，一架波音727从首尔起飞前往济州岛途中被一名劫机犯劫持并试图飞往朝鲜。
1987年11月29日，大韩航空858号班机空难（波音707）从阿联酋首都阿布扎比飞往泰国曼谷。在缅甸Tavoy市东北约122公里（76.3英里）处上空爆炸解体。调查显示，2名恐怖分子扮成乘客，将一台收音机和一个藏有炸药的酒瓶藏在机舱第7排座位的行李架内。11名机组人员和104名乘客全部死亡。
1989年7月27日，大韩航空803号航班空难（麦道DC10）从沙特阿拉伯吉达市起飞前往利比亚首都的黎波里。由于天气恶劣，加上机组人员在燃油消耗方面的计算失误，导致飞机在降落至27号跑道之前因燃油耗尽而坠毁。3名机组人员（共18名）、72名乘客（共181名）和4名地面人员死亡。
1989年11月25日，一架福克F-28型客机从首尔飞往蔚山，由于地面工作失误，在起飞途滑行中，因机翼结冰导致一台发动机停顿。机师失去方向控制，决定放弃起飞。飞机高速冲出跑道并爆炸起火。幸好并无酿成伤亡。